Die Kartause wird von Heidenreich von Maissau und seine Gemahlin Anna von Kuenring gegründet. 1373 wird der Grundstein gelegt, 1377 ziehen die ersten Mönche ein (sie kommen aus Mauerbach), 1380 wird die Kirche eingeweiht. Von 1387 bis 1391 war Michael von Prag Prior von Aggsbach.

Bis in das 18. Jahrhundert war das Kloster Eigentümer von mehreren Herrschaften in Niederösterreich (darunter Purgstall, Seiterndorf, Großmugl, Külb, Kühbach und Strohdorf) - 1723 waren es insgesamt zwölf. Im 16. und 17. Jahrhundert waren die Zeiten schlimm, die Kämpfe gegen die Türken erforderten hohe Steuerleistungen, die Reformation setzte den Klöstern stark zu. In der 2. Hälfte des 16. Jahrhunderts waren nur mehr wenige Mönche im Kloster wodurch der Verfall der Anlagen begann.

Die Anlage wurde in den Jahrzehnten um 1600 unter Abt Thomas Mangold im Stil der Renaissance wieder hergestellt. Von 1661 bis 1699 wurde die Kirche renoviert. 1782 wurde das Kloster durch Kaiser Joseph II aufgehoben und in ein Schloss umgewandelt. Teile des Klosters wurden in die Räumlichkeiten des Pfarrhofes übernommen, die Kartäuserzellen und der große Kreuzgang geschleift. Die Kartäuserkirche erhielt einen Kirchturm und wurde zur Pfarrkirche. Untersuchungen durch das Bundesdenkmalamt im Jahr 2010 legen die Vermutung nahe, dass das Baumaterial für den Kirchturm von den abgerissenen Zellen stammt.

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