Die Herrschaft gehörte ursprünglich dem Salzburger Erzbistum. Es belehnte damit die Grafen von Hernstein, die im nahen Krustetten saßen und Meidling als Afterlehen weitergaben. 1182 werden die Ritter Wolker und Herbord von Meidling als Inhaber erwähnt.

Nach dem Aussterben der Grafen von Hernstein übernahmen die Grafen von Hardegg das Salzburger Lehen. Meidling blieb bis 1715 Lehensbesitz der Hardegger, die Burgherren von Meidling wechselten aber sehr häufig. Wie die im dritten Viertel des 14. Jahrhunderts hier lebenden Pixendorfer nannten sie sich oft nach Meidling. 1449 ließ Ritter Jörg Prantner den Wehrbau mit einer neuen Kapelle ausstatten.

1478 besetzten die mit den eingefallenen Ungarn verbündeten Freiherren von Hohenberg die Burg. 1481 wurde sie aber wieder kaiserlich. 1560 verkaufte Leopold Weirhofer Meidling an die Brüder Andreas und Josef Tadolt von Catanias, die auch das Hardegger Lehen bekamen. Im 16. und 17. Jahrhundert kam es neuerlich zu einem mehrfachen Besitzwechsel. 1705 war Maximilian Anton von Salla Burgherr. Schließlich tauschte 1715 Graf Johann Karl von Kuefstein die eben erst erstandene Herrschaft gegen Besitzungen des Stiftes Göttweig ab. Die Grafen von Hardegg verzichteten auf ihre Lehensrechte, so dass Meidling nun freies Eigen des Stiftes war. Abt Gottfried von Bessel begann sofort mit dem Bau des jetzigen Schlosses. 1888 wurden die Gebäude renoviert und teilweise vermietet. 1968 wurde die Anlage vom Justizministerium gekauft und diente als Außenstelle der Haftanstalt Stein. In den Jahren 1970 bis 1980 wurde eine Generalsanierung durchgeführt. Seit 2012 befindet sich das Anwesen wieder in Privatbesitz.

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