Das heutige Schloss geht in seinem Kern auf das zu Beginn des 11. Jahrhunderts erbaute "Feste Haus" des Purchart de Louppah zurück. 1133 scheint ein Albero de Purchartesdorf auf. Eine Wasserburg wird 1255 erstmals urkundlich erwähnt. Sie gehörte damals Heinrich von Kreuzenstein. Die Lehensherrschaft lag bei den Herren von Lengenbach.

1284 gelangte ein Anteil der Burg an den Deutschen Ritterorden. Im ersten Viertel des 14. Jahrhunderts kam Purkersdorf durch Heirat an Reinprecht I von Wallsee, der die Herrschaft Purkersdorf 1333 an die Habsburger verkaufte. Von 1500 bis 1788 hatte das kaiserliche Waldamt hier seinen Sitz. 1788 erfolgte dessen Vereinigung mit dem Oberstjägermeisteramt in Wien.

Im Schloss Purkersdorf verblieb bis zur Aufhebung 1830 das Oberforstamt Purkersdorf. Ab 1830 diente das Schloss Purkersdorf als einfaches Forstamt. Das Schloss wurde 1529 während der Ersten Wiener Türkenbelagerung durch Brand zerstört und anschließend von 1533 bis 1553 trockengelegt und wieder aufgebaut. 1683, während der Zweiten Wiener Türkenbelagerung, fiel es den Türken erneut zum Opfer. Kaiser Leopold I ließ die nunmehr Schloss genannte ehemalige Wasserburg 1684 bis 1688 ohne Türme wieder herstellen.

Nach einem Großbrand, im Jahre 1842 sollte das Schloss demoliert werden. Nachdem Sprengversuche erfolglos geblieben waren, entschloss man sich das Gebäude wiederherzustellen. 1896 wurden die Reste des Wassergrabens und der Befestigungsanlagen abgetragen. 1925 gelangten die Österreichischen Bundesforste in den Besitz des Schlosses. In den Jahren 1983 bis 1985 wurde dieses umfassend restauriert. Neben dem Bezirksgericht und einem Ärztezentrum ist auch das Stadtmuseum im Schloss untergebracht.

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